画中描绘的是亚西西的圣方济各，他身着简朴的灰褐色修士长袍，双足赤裸，手持十字苦像与经书，体现出方济各会的清贫与苦修理想。人物立于抽象化的深蓝背景前，背景几乎完全去除了具体环境，这一处理把观者的注意力集中在圣人本身与其内在灵性的呈现上。画幅周围以赭红与淡色形成装饰性边框，具有小型祭坛画或宗教小像的特征，可能原本属于多联祭坛的一翼，用于私人祈祷或小型礼拜空间。

此作整体风格仍带有意大利早期文艺复兴晚期的板画气质，人物比例略纤长，站姿略带曲线式的反转姿势（contrapposto），但体块感尚不如拉斐尔成熟期作品那样饱满有力。圣方济各圆润而略显稚气的面庞、柔和的眼神与微微前倾的姿态，传达出谦卑温和的性格特征。画家以细密而温柔的笔触处理修道袍的褶皱和质地，淡雅的灰褐色与深蓝背景形成柔和却清晰的明暗对比，使人物从背景中凸显出来，又保持了宗教图像应有的肃穆、内敛氛围。

色彩方面，画面主调克制而朴素，以冷暖对比营造灵性的静穆感：冷调的蓝色背景象征神圣与超越，暖调的肉色与木质十字架、赭红色书册则指向人间经验与教义文字。画中几乎没有戏剧性的光线效果，而是通过均匀柔和的光照塑造体积，显示出拉斐尔早期对翁布里亚画派（如佩鲁吉诺）风格的继承——宁静、理性、虔敬。这幅《圣方济各》虽非拉斐尔最著名的大型作品，却清晰展现了他在青年时期对宗教人物心理刻画和优雅气质的追求，对后来的盛期文艺复兴肖像与圣像创作具有重要的过渡意义。